Científicos del Instituto Internacional de Investigación Ganadera y colegas publicaron un nuevo estudio en BMC Genomics (julio de 2022) que describe el desarrollo de una herramienta computacional para la vigilancia genómica del virus de la fiebre del Valle del Rift que puede ayudar en la detección y el control rápidos de la fiebre del Valle del Rift. , una enfermedad zoonótica viral que afecta tanto a humanos como a animales como vacas, ovejas, cabras y camellos.
La nueva herramienta computacional puede clasificar y asignar rápidamente linajes de aislamientos de fiebre del Valle del Rift. La herramienta se basa en el gen de la glicoproteína y en las secuencias del genoma completo de los virus aislados. Está disponible como herramienta de línea de comandos y como aplicación web alojada en https://www.genomedetective.com/app/typingtool/rvfv/ .
Las pruebas y la validación de la herramienta en cuanto a especificidad, sensibilidad y precisión muestran que es útil para rastrear el origen de los brotes de enfermedades.
Cita
Juma, J., Fonseca, V., Konongoi, SL, Heusden, P. van, Roesel, K., Sang, R., Bett, B., Christoffels, A., Oliveira, T. de and Oyola, SO 2022. Vigilancia genómica del virus de la fiebre del Valle del Rift: desde la secuenciación hasta la asignación del linaje. BMC Genomics 23: 520.